Биология — молекулярный уровень

Базовый словарь генетики: ген, аллель, полиморфизм, экспрессия, наследуемость, полигенность. Что такое SNP-маркер, как работает гетерозигота, почему «ген депрессии» не существует.

Ген, аллель, генотип, фенотип

Ген — кусок ДНК, кодирующий какую-то функцию: один рецептор, один фермент, одну сигнальную молекулу. Не «ген доброты» или «ген депрессии», а буквально инструкция для конкретного белка.

Аллель — вариант гена. У большинства генов есть несколько устойчивых вариантов в популяции: «обычный» (дикий тип) и один-два с заменами в коде. Аллели различаются буквально одной-двумя буквами в ДНК.

Гомозигота / гетерозигота — у человека два набора хромосом, по одному от каждого родителя. Если оба аллеля одинаковые — гомозигота (обозначают 0/0 или 1/1). Если разные — гетерозигота (0/1).

Генотип — что записано в ДНК (например, COMT Val/Met). Фенотип — что из этого реально проявилось в организме (быстрая или медленная инактивация дофамина в префронтальной коре).

Генотип ≠ фенотип. Один генотип может давать разные фенотипы в зависимости от среды, эпигенетики, других генов. См. Эпигенетика.

Как работает гетерозигота

У человека с генотипом Aa (одна копия аллеля A, одна — a) фенотип детерминирован, а не вероятностен. Вопрос только в том, как два аллеля комбинируются. Три типа взаимодействия:

ТипЧто происходит у AaГде встречается
Доминантный + рецессивныйДоминантный маскирует рецессивный — фенотип «как у AA»Менделевская классика: цвет глаз, моногенные болезни (фенилкетонурия)
Аддитивный / неполное доминированиеОба аллеля работают, фенотип промежуточный между AA и aaБольшинство SNP, связанных с поведением и личностью — COMT, OXTR, BDNF
КодоминантныйОба аллеля проявляются полностью и одновременноГруппы крови (AB)

Для поведенческой генетики главное — аддитивный эффект. Например, COMT Val/Met работает быстрее, чем Met/Met, но медленнее, чем Val/Val. Это гарантированно промежуточная активность фермента, а не «50% шанс быть как один из гомозигот». Гетерозигота — это не «вероятностное состояние», а самостоятельный фенотип, ровно посередине между двумя гомозиготами.

Пенетрантность — отдельный концепт: вероятность, что генотип в принципе проявится в фенотипе. Для мутации BRCA1 пенетрантность ~70% — даже у носителя мутации рак не гарантирован. Для большинства SNP личности концепт пенетрантности не применяется — там работают аддитивные малые эффекты, а не «проявится / не проявится».

SNP, VNTR, полиморфизм

Полиморфизм — устойчивое различие в ДНК между людьми. Обычно бывает двух типов:

  • SNP (Single Nucleotide Polymorphism, «снип») — замена одной буквы в ДНК. Самый частый тип. Записывают так: rs4680 — это идентификатор конкретного SNP в международной базе. Например, COMT rs4680 — замена в гене COMT в позиции 158, может быть Val (валин) или Met (метионин).
  • VNTR (Variable Number Tandem Repeat) — переменное число повторов короткой последовательности. Пример: DRD4 7R — это «семь повторов» определённого мотива в гене DRD4. У разных людей разное количество повторов, отсюда варианты длины.

5-HTTLPR — VNTR в гене транспортёра серотонина: long-вариант и short-вариант.

SNP анализируется массовыми SNP-чипами (Genotek, 23andMe). VNTR требует отдельного анализа — поэтому в стандартном генетическом тесте 5-HTTLPR и DRD4-повторы обычно отсутствуют.

Экспрессия гена

Ген — это инструкция. Чтобы инструкция сработала, её нужно «прочитать» — это и есть экспрессия. Гены не работают «всегда», они включаются и выключаются в зависимости от типа клетки, времени развития, гормонов, внешних стимулов.

Один и тот же геном (одинаковый во всех клетках тела) даёт нейроны, печень и кожу — потому что в каждой клетке экспрессируется свой набор генов.

Уровень экспрессии может меняться:

  • В пределах часов и минут — от сигналов в моменте
  • В пределах лет — от длительного опыта (через эпигенетику)
  • На протяжении жизни — от созревания и старения

Главное: наличие гена ≠ его работа. Ген может быть в ДНК, но молчать. То, какие гены реально экспрессируются и в какой момент жизни, определяется отдельным регуляторным слоем — эпигенетикой.

Наследуемость

Наследуемость (heritability) — это популяционная статистика, а не индивидуальная.

«Личностные черты наследуемы на 40–60%» означает: если посмотреть на разброс черт в популяции, 40–60% этого разброса объясняется генетическими различиями между людьми, остальное — средой.

Это не значит «у этого человека 50% характера от генов, 50% от среды». У отдельного человека генетика и среда не разделяются — они работают вместе.

Откуда берётся цифра: близнецовые исследования. Сравнивают сходство монозиготных близнецов (100% общих генов) с дизиготными (50%). Разница в сходстве пропорциональна вкладу генетики.

Полигенность

Подавляющее большинство сложных черт — полигенны: определяются сотнями или тысячами генов малого эффекта, плюс среда.

«Ген депрессии» не существует. Есть сотни SNP, каждый из которых даёт прибавку ~0.1% к риску. Складываются — даёт реальный риск, но никогда не «гарантию».

То же самое для личностных черт, IQ, склонности к зависимостям, иммунных особенностей.

Исключение — моногенные болезни (фенилкетонурия, муковисцидоз). Один сломанный ген → определённый фенотип. Но это редкая ситуация.